生物肥料，也被稱為微生物肥料，是指對農(nóng)業(yè)有益并且通過生物發(fā)酵生產(chǎn)的生物制劑。 它是生產(chǎn)綠色食品的重要原料。 生物肥料在提高肥力，利用化肥，抑制農(nóng)作物吸收硝態(tài)氮，重金屬和農(nóng)藥，凈化和修復(fù)土壤，減少作物病害，提高作物產(chǎn)品質(zhì)量和食品安全方面顯示了不可替代的作用。生物肥料是含有大量有益微生物的肥料，并且基于這些微生物的生物化學(xué)作用來改善作物營養(yǎng)和生長條件。 有益微生物主要有根瘤菌（生物固氮），解磷細(xì)菌（活性土壤中不溶磷），釋鉀細(xì)菌（又稱硅酸鹽細(xì)菌，土壤中礦質(zhì)鉀的分解釋放），抗生素如5406 （能夠抑制或殺死有害真菌和細(xì)菌，刺激作物生長并激活土壤不溶性磷和酶細(xì)菌（促進(jìn)有機(jī)轉(zhuǎn)化）。真菌肥料的實(shí)際肥效通常也與微生物生活的基質(zhì)有關(guān)微生物肥料的主要類型是農(nóng)業(yè)細(xì)菌劑，復(fù)合微生物肥料和有機(jī)有機(jī)肥料。

化肥的推廣在提高中國農(nóng)業(yè)生產(chǎn)和收入方面發(fā)揮了關(guān)鍵作用。但長期單一施用化肥導(dǎo)致生態(tài)環(huán)境，土壤理化性質(zhì)和土壤微生物群落受到不同程度的破壞，在一定程度上對農(nóng)業(yè)造成了污染產(chǎn)品，降低土壤肥力，并影響土壤微生物和酶活性。農(nóng)作物產(chǎn)量和質(zhì)量下降，農(nóng)產(chǎn)品難以滿足綠色食品的要求。目前，適合生產(chǎn)無公害綠色食品的生物有機(jī)肥受到廣泛關(guān)注。生物有機(jī)肥是指具有微生物功能的肥料和通過特定功能性微生物和家畜糞肥，農(nóng)作物秸稈等的組合使用而產(chǎn)生的無害分解的肥料。因此，它結(jié)合了有機(jī)肥料和生物肥料的優(yōu)點(diǎn)，不僅有利于增產(chǎn)增收，而且有利于土壤施肥，改善土壤微生態(tài)系統(tǒng)，減少無機(jī)肥料用量，改善提高農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量。

生物肥料分類：

生物肥料按微生物的種類劃分為:根瘤菌、固氮菌、芽孢桿菌、光合細(xì)菌、纖維素分解菌、乳酸菌、酵母菌、放線菌和真菌。其中以根瘤菌的研究最深入、應(yīng)用最廣泛。當(dāng)前我國生產(chǎn)上使用的菌種主要為根瘤菌、固氮菌、解鉀菌等, 主要的生物肥料品種有根瘤菌肥料、固氮菌肥料、解磷菌肥料、硅酸鹽細(xì)菌肥料等。